长荣大学（英语：Chang Jung Christian University，CJCU），是一所位于台湾台南的私立大学，设有管理学院、健康科学学院、人文社会学院、资讯暨工程学院、基督教研修学院等五个学院。
台湾基督长老教会是普世长老教会及改革宗教会大家庭的一份子。它的历史根源，可以上溯至台湾三大西方医疗传道之滥觞，此即公元1865年英国长老教会宣教师马雅各医生在南部之宣教，及公元1872年加拿大长老教会宣教师马偕博士在北部所开展的宣教工作，及公元1896年英国基督长老教会宣教师梅坚雾与兰大卫在彰化进行医疗传道事工。
公元1865年由英国基督长老教会宣教师马雅各医师（Dr. James L. Maxwell, M.A., M.D., 1836-1921） 奉差派来台湾，选定台湾府（就是台南）做英国长老教会台湾宣教的中心，在台南（看西街亭仔脚）设医馆及礼拜堂，进行医疗传道事工。在从事医疗传道工作时，开始慢慢地带给台湾地区人民新生、进步和繁荣的希望。同时，也为本地人民带来西方文明思想，使台湾的医术科学化，并对世界的历史、天文、地理和数学常识有更深一层的认识。当时英国教会派到台湾的宣教师都是英国杰出的医师、教育家和科学家，他们一起到台南首创新楼医院，立刻展开医疗和传道的工作，接著帮助民众吸收中西文化、科学知识、圣经要义及基督教的福音。约於公元1870年在各地教会开设小学，并於公元1883年3月15日决定创办教会中学。公元1885年9月21日（清光绪11年），正式由英国基督长老教会选定府城台南，创办了台湾第一所西式中学－「长老教会中学」，即今日「长荣高级中学」的前身，迄今已有126年的悠久历史，首任校长为余饶理先生（Mr. George Ede）。
公元1954年长荣中学第二任董事长陈明清先生，考察日本大学的发展趋向，并研究日本基督教大学的特色後，经台湾基督长老教会总会议决通过，由陈明清、吴基福等15名董事筹组「长荣文学院」第一届董事会，可惜受当时教育部对於设立大学禁令所限，未能如期进行筹设。长荣中学第三任董事长（公元1963-1965年）侯全成先生任内，设立大学的禁令尚未解决，希望先设立专科学校，但是为众议所阻。长荣中学第四任董事长（公元1965-1989年）吴基福先生任内，仍积极计画并提出具体方案，仍为法令所限一直停留在筹备阶段。公元1985年，黄仁村先生接任长荣中学第五任董事长，适逢教育部解除设立私立大学禁令，遂与长荣中学校长蘇进安博士、长荣女中董事长刘快治女士共同研议创设「长荣工学院」，以延续长老教会对台湾文化、教育、医疗的功劳与贡献。
公元1988年3月正式向教育部提出申请後，於公元1989年6月获得教育部核准筹设「长荣工学院」，并於当年8月成立长荣工学院董事会，奉准备查（台7842620号），由长荣中学校友会总会长高育仁先生荣任董事长。 公元1990年2月3日完成财团法人设立登记（南院民法登3781号）。
公元1992年11月16日长荣工学院奉准改为长荣管理学院（台81高62959号），公元1993年2月16日财团法人私立长荣管理学院登记核准（南院民法登9171号）。聘请林邦充教授为首任院长，并且参与82学年度大学联招，设「资讯管理」、「企业管理」、「国际企业」、「会计」等四个学系，获核定招收新生200名，在我国高等教育发展史上，树立基督徒办学之里程碑。之後，历经数次申请改名大学，终於公元2002（民国91年）10月1日奉教育部台（91）高（3）字第91137638号函核定，自91学年度起改名为「长荣大学」。