大气科学专业前身为1971年设立的气象学专业，30多年来为国家培养了大批大气科学领域的专业人才，他们中的许多人已成为各单位的业务骨干或走上领导岗位。大气科学系现设有大气科学本科专业，并有气象学博士学位授权和气象学、大气物理学与大气环境2个硕士学位授权。气象学是云南省重点学科，大气科学是云南省重点专业、国家优势特色学科。
目前设有我国高校唯一的世界气象组织大气臭氧BREWER地面观测站，拥有供学生实验和实习使用的VSAT卫星地面接收站、MODIS卫星地面接收站、711-XDR数字天气雷达、气象观测实习台、曙光天潮高性能计算机集群等设备。
近三年来该专业许多应届毕业生考取国家知名研究院所，也有很多直接就业。毕业生在校期间培养了较高的科学人文素养、较强的实践创新能力、较好的专业知识技能，很受用人单位的欢迎，毕业生就业率连续三年达到100％。
近年来，随着国家和社会对大气科学事业日益重视，该专业显示了良好的就业前景。
培养目标：本专业有全球气候变化与热带季风、紫外线辐射及其气候环境效应、气候诊断与旱涝预测、大气环境与气候变化等4个主要研究方向，旨在培养具备良好的科学素养和扎实的大气科学基本理论知识，具有进行大气科学基础应用、数据处理和计算机应用的基本技能，能够在大气物理、大气环境、大气探测、气象学、气候学、应用气象及相关学科从事业务及相关管理工作的专门人才。学制四年，授予理学学士学位。
主干课程：高等数学、概率论与数理统计、数学物理方法、理论力学、流体力学、大气动力学基础、计算方法、数值天气预报、现代气象观测、大气物理学、天气学、气象统计预报、雷达气象学、卫星气象学等。
就业方向：本专业毕业生主要在各省市气象、环保、教育部门从事科研和业务工作，也有部分毕业生到部队就业。