船舶概论、海洋运输业务、财务管理、系统工程、交通运输学、交通运输企业经营管理、管理学、港口管理、组织行为学、毕业实习等，以及各校的主要特色课程和实践环节。
水运管理专业学生主要面向珠三角各类港口企业、航运企业、港航物流企业、国际货运代理企业、国际物流企业等单位从事港口经营管理、港航物流服务、港口理货、保税区仓储管理、集装箱运输组织、报关等工作。也可报考公务员，从事各级交通主管机关、港航行政管理等部门从事交通综合执法、水路运输行业管理的相关工作。