主干学科：蒙医基础理论、蒙医临床医学。主要课程：蒙医基础理论、蒙医诊断学、蒙药学、蒙医方剂学、(四部医典)导读、蒙医疗学、蒙医温病学、蒙医内科学、人体解剖学、生理学、诊断学、内科学、中医学。主要实践性教学环节：包括采药认药、制药实习、临床见习、毕业实习等，一般安排56周。